新生儿出血症

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基于GCMS的代谢组学策略区分三类急性 [复制链接]

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急性胰腺炎(acutepancreatitis,AP)是一种发病率高、死亡率高的炎症性疾病,它的病因主要有饮酒、胆道疾病和高脂血症。胆道急性胰腺炎(BAP),酒精性急性胰腺炎(AAP)和高脂血症急性胰腺炎(HLAP)分别占AP总发病率的43.83%、17.00%和6.17%。早期诊断不同类型的AP,进一步探索各类型AP的潜在病理生理机制,有利于优化治疗策略和更好地照顾患者。

来自湖南中医药大学的团队,采用气质联用的代谢组学方法和随机森林算法体系,使BAP、HLAP和AAP患者与健康对照组相比,疾病分类准确性为0.、0.和0.。

主要结果呈现如下:

四个组的总离子流色谱图(TIC)呈现如下:BAP、AAP、HLAP与健康对照组血清代谢物组成相似,但这些代谢物的水平有差异。

对BAP、AAP、HLAP与健康对照四个组的代谢谱进行定性定量分析,并将得到的32个代谢物,进行建立的随机森林算法(RF)模型来区分BAP、AAP、HLAP与健康对照,区分结果图如下:

VIP参数被广泛应用于生物标志物的筛选,可以间接反映代谢产物与疾病的相关性。通过RF得到各变量的分类重要性图。一些代谢物如L-酪氨酸、十八酸、胆固醇、甘油、L-十六烷酸和L-乳酸等在区分AP患者与健康人方面表现出一致的趋势。

此外,为了探索三种AP类型的潜在代谢途径,他们将各组中具有显著差异的潜在生物标志物引入MetaboAnalyst,以探索KEGG(KyotoGeneandGenomicEncyclopedia)的代谢途径。

五种重要的代谢途径(氨酰基t-RNA生物合成,硫胺素代谢,糖酵解或糖异生、丙酸代谢和氮代谢)在BAP中受到干扰;五种重要的代谢途径(氮代谢,氨酰基-t-RNA生物合成,硫胺素代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成以及糖酵解或糖异生)在HLAP中均受到干扰;五种重要的代谢途径(氨酰基-t-RNA生物合成、氮代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、脂肪酸生物合成)在AAP中受到干扰。

-------------------鸣谢-----------------

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