第一、最常见的症状是发热，体温多数超过38℃，热型可不规则或低热，少数病例体温可正常。
第二、心功能不全及心脏杂音，部分病例呈现心功能不全或原有心功能不全加重。
第三、会有血管征象
瘀斑（球结膜、口腔黏膜、躯干及四肢皮肤）及Janeway斑（手掌和足底红斑或无压痛的出血性瘀点）较少见；
主要血管（肺、脑、肾、肠系膜、脾动脉等）栓塞是感染性心内膜炎的重要合并症，可出现相关部位的缺血、出血症状（如胸痛、偏瘫、血尿和腹痛等）。
第四、会有免疫征象
指（趾）甲下出血（呈暗红、线状）、Osier结节[指（趾）掌面红色皮下结节]及Roth斑（眼底椭圆形出血斑，中央苍白）均不是感染性心内膜炎特有的症状，临床较少见。
免疫复合物性肾小球肾炎可见于部分感染性心内膜炎病例，可表现为血尿、肾功能不全。